熒光顯微鏡是光學顯微鏡的一種，是免疫熒光細胞化學的基本工具。以紫外線為光源，用以照射被檢物體，使之發出熒光，然后觀察物體的形狀及其所在位置。用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等。

 

熒光顯微鏡是以紫外光或藍紫單色光激發標本來產生熒光，因為紫外光不可見，故由標本發出的熒光與背景反差很大，即熒光顯微鏡通常在黑暗的背景下觀察彩色的圖像;而普通顯微鏡是在明亮的背景下觀察較暗的樣品。這樣熒光顯微鏡的對比度比普通顯微鏡提高約100倍，因此可觀察到普通顯微鏡下看不到的結構細節。熒光顯微鏡具有對比度高這個突出的優點，得到了廣泛的應用。

 

熒光顯微鏡有兩種不同類型：

 

1.透射式熒光顯微鏡

 

它和普通光學顯微鏡類似，光源是從鏡座出發經過聚光鏡到達樣品激發熒光后通過物鏡，最后到達目鏡。

 

2.落射式顯微鏡

 

大部分的熒光顯微鏡也是采用這種類型。它的光源是通過物鏡落到樣品上，激發熒光以后再發射回物鏡，最后到達目鏡。

 

不論是透射式的熒光顯微鏡還是落射式的，它們的光源都要經過激發濾色鏡過，濾掉一部分的可見光。激發樣品發出熒光后，還要經過阻斷濾色鏡，過濾掉一部分多余的激發光。最終，這使得我們觀察到的是熒光物質染色部分所發出的熒光。